Драги микроб

Share Tweet Pin it

Пошто је време Пастеур је познато да је систем органа за варење, у суштини тип биореактор ток у коме мноштво микроорганизама настањују. Став научника према цревној микрофлори током овог времена радикално се променио. Пре сто година, велики Иља Мечникова, оснивач модерне теорије имунитета, за стварање од којих је добио Нобелову награду (за две особе са својим неумољиве противник, не мање од великог Пол Ерлих), чак предложио уклањање дебелог црева као начин за продужење живота. И оне којима је ова мера је изгледало сувише радикалан, препоручује се да пије пуно јогурта да раселе штетна, по његовом мишљењу, микроби благотворно лактобацила. За пола века курс се променио за 180 степени. Испоставило се да су нормалне цревне микрофлоре, као и коже и слузокоже, за обављање многе корисне функције - на пример, потискују виталне функције тела су стално нападају патогене. И у последњих неколико година, највише смело од микробиолога су отишли ​​даље изјавом лица и његове симбиотичку микроба један суперорганисм.

Развој техника молекуларне биологије донела је научницима нови ниво разумевања процеса симбиозе човјека и његове микрофлоре, који је изгледао добро студирао, а из студије које нису очекивали било изненађења. Стопа брз раст и пад трошкова метода ДНК секвенцирања (утврђивање његовог нуклеотидне секвенце) и паралелни повећање моћи персоналних рачунара и развој Интернета омогућила је анализу информација о великих региона генома. Након хромозому стотина појединачних бактерије врсте транскрибовани у новом генетику микроорганизама приступ - становништво: анализа гена одједном све бактерије настањују одређену станиште. Наравно, становништво "људског биореактора" испоставило се као једно од најважнијих за проучавање микробних популација.

Први рад, који је направио нови поглед на интестиналну микробиото, објавила је 1999. године група научника из Националног института за агрономска истраживања (Француска) и Универзитета Реадинг (Велика Британија). Аутори су одлучили да користе метод секвенцирања 16С РНК гена за проучавање популације микробних цревних ћелија.

16С РНА - идентификација бактерија

Од времена Пастеура, прва и неопходна фаза у одређивању микроорганизама била је њихова култивација на хранљивим медијима. Али многи важни (и корисни и патогени) микроби не желе да расте на било ком медијима. Студи претходно неприступачним необрадиве бактерије и почињу да очисти потпуно збуњујући таксономија познатих прокариотима постало могуће развојем биоинформатици и појаве модерних техника молекуларне биологије - полимераза ланчаном реакцијом (ПЦР), што омогућава иједан ДНК за добијање милионе и милијарде Тачне копије, клона изолованих из ПЦР гена у бактеријских плазмида и нуклеотидних метода секвенцирања, добијени све ово довољни за ана Иза износ.

Идеалан маркер за идентификацију микроорганизама показали геном који кодира 16С рибосомал РНК (сваки од два рибосома субјединице - радионице синтезу ћелијског протеина - садржи преплитања ланаца протеинских молекула и рибонуклеинских киселина).

Овај ген је у геному свих познатих бактерија и арцхаеа, али нема у еукариота и вируса, а ако нађе карактеристичан низ нуклеотида - да ли сте сигурни да се баве гена Прокариотес. (Да будемо врло прецизни, ген 16С РНК тамо и код еукариота, али не иу нуклеарним хромозома и Митоцхондриал Ово још једном потврђује да митохондрије -. Дистант потомци симбиотске бактерија првих еукариотским организмима.)

Овај ген има и конзервисани региони су исти у свим прокариотима и врста специфичне. Конзервативне парцеле су за прву фазу полимераза ланчаном реакцијом - додавање циљне ДНК до прајмера (семена ДНК делови којима проучавао нуклеотида ланца треба да уђе да бисте започели анализирање остатак секвенце) и са специфичним врстама - за идентификацију врста. Поред тога, степен сличности секција врста специфичне одражава веома добро еволуциону везу различитих врста.

Додатни бонус - за клонирање и накнадну анализу, можете користити саму рибосомну РНК, која је у било којој ћелији присутна у много већој количини од одговарајућег гена. Само је прво морамо "преписати" у ДНК помоћу специјалног ензима - реверзне транскриптазе.

Генерално доступне су нуклеотидне секвенце 16С РНК свих познатих бактерија и археа (око 10.000 врста). Идентификоване секвенце се упоређују са онима пронађеним у базама података и тачно идентификују врсту бактерије или изјављују да припада следећим необрађеним врстама.

Недавно је дошло до интензивне ревизије старе, фенотипске класификације бактерија засноване на лоше формализованим критеријумима - од појаве колонија до жеље за храном и способности да се мрље различитим бојама. Нова систематизација се заснива на молекуларним критеријумима (16С РНА) и само делимично понавља фенотип.

Секвенце кодирање 16С РНК помоћу ПЦР је добијено директно из "окружења" - 125 милиграма човека, извини, столица, је убачен у плазмид Е. цоли (не зато што интестинални, и зато Есцхерицхиа цоли - један од молекуларних биолога омиљени воркхорсе ) и поново изолован из културе помножених бактерија. Тако је створена библиотека са 16С РНК геном за све микроорганизме у узорку. Након тога, 284 клона су насумично изабране и секвенциране. Испоставило се да су само 24% резултујуће 16С РНК секвенце припадале раније познатим микроорганизмима. Три четвртине микрофлоре се налази у цревима сваког људског бића, више од стотину година избегавао пажњу истраживача, наоружани са методама класичне микробиологије! Научници једноставно нису могли наћи услове за култивисање ових бактерије, пошто највише ћудљив становници црева одбио да порасте на традиционалним микробиолошким срединама.

До сада, користећи молекуларне методе, утврђено је да је 10 од 70 великих бактеријских таксона присутно у микробиоти одраслих. Око 90% наших микроба припада типу фирмицутес (ово укључује, на пример, познати лактобацила - главни "кривци" соуринг млеко) и Бацтероидетес - обавезати анаероба (организми који могу да живе само у одсуству кисеоника), који се често користе као показатељ загађења природна канализација. Преосталих 10% становништва подељена између таксона протеобактерије (што укључује, између осталог, Е. цоли), Ацтинобацтериа (из једне од врста актиномицета антибиотика стрептомицина је изолован), Фусобацтериа (нормалне становници усне дупље и често изазивају пародонтопатија), Верруцомицробиа (недавно у геотермални извор је открио облик микроба који се хране на метан, који обилују у цревима због других микроорганизама), Цианобацтериа (они су и даље често називају старом називом "плаво-зелене алге»), Спироцхаеатес (за Ваит ТЕВ, не бледи), Синергистес и ВадинБЕ97 (каква животиња, питајте креатори новог таксономији прокариота).

Упркос чињеници да је састав врста честих микроорганизама прилично монотоничан, квантитативни однос представника одређених систематских група у микробиоти различитих људи може значајно да варира. Али шта је то нормална цревна микрофлора и какви су начини његовог формирања?

На ово питање је одговорено 2007. године у раду групе америчких биолога под водством Патрика Брауна са Универзитета Станфорд. Они су пратили формирање микробиоте код 14 новорођенчади током прве године живота. Аутори су успели да успоставе неколико извора колонизације гастроинтестиналног тракта. Микробиота беба је била слична микрофлору мајке: вагинални, фекални или микрофлора узорака мајчине масти. У зависности од извора колонизације, у микрофлору црева дојенчади током прве године живота, преовладавају различите врсте. Ове разлике су остале значајне током читавог периода истраживања, али у доби од једне године постале су очигледне особине формирања одрасле микробиоте. Занимљиви подаци су добијени коришћењем пара близанаца. Њихова микрофлора је практично идентична у саставу и на исти начин варира. Овај налаз открио је огромну улогу људске компоненте микробиотског пара домаћина у формирању популације цревних микрофлора. За чистоћу експеримента, наравно, требало би да одвојимо бебе назад у болницу - одличну причу за индијски филм! Током година, они познају... Али анализа других студија података потврдила претпоставку да је појединац, укључујући и наследне, карактеристике људских биохемија имају велики утицај на састав његовог мицробиота.

Микробиолошки у нама је више од људског

Поред проучавање одређених врста цревне микрофлоре, последњих година многи истраживачи проучавају бактеријску метагеном - скуп гена свих организама у узорку садржаја људског црева (или испирања коже, или у блата узорку од морског дна). За ту сврху, највише аутоматизована, компјутеризовани и високих перформанси ДНА секвенцирање технологије које омогућују анализу кратких нуклеотидне секвенце, прикупити слагалице неколико цоинцидент "слова" на крајевима ових делова, мултипле Понављајте ову процедуру за сваки комад генома и примају декодирање појединачних гена и хромозома стопи до 14 милиона нуклеотида на сат - реда магнитуде брже него што је то учињено пре само неколико година. Тако да је пронађено да људско цревни микробиота има око 100 бактеријске ћелије триллионов - око 10 пута више од укупног броја мастер ћелија у телу. Скуп гена који чине бактеријски метагеном је око 100 пута већи од скупа гена људског тела. Ако говоримо о износу од биохемијских реакција које се дешавају унутар микроба становништва, опет много пута већа него у људском телу. Бактеријска "реактор" имплементира у домаћина метаболички ланац да то није у стању да се подрже - на пример, синтеза витамина и њихови прекурсори, разградња неких токсина, разлагање целулозе према сварљивих полисахариде (код преживара), итд

Студије спроведене у лабораторији Јеффреи Гордон (Сцхоол оф Медицине на Универзитету Вашингтон, Ст. Лоуис, МО) ће се привезати разноликост врста бактерија гастроинтестиналног тракта дијета и карактеристика индивидуалног метаболизма. Резултати експеримента објављени су у децембарском издању Природа 2006. године. Годишњи експеримент је предложио успостављање корелације између вишка телесне масе и састава микробне популације његове цревине. Десетине младих који су пристали да ставе своје стомаче на олтар науке подељени су у две групе. Једно село на дијети са мастима, друго - са садржајем угљених хидрата. Све волонтера смршао, а истовремено су променили однос две главне групе цревним микроорганизмима: број ћелија фирмицутес смањен, док је број Бацтероидетес, напротив, повећава. На ниским исхране масти таква промена постао истакнути касније - након што су пацијенти изгубили 6% по маси, и ниско-угљених хидрата - након што је изгубио први килограма (2% од почетне телесне тежине). У исто време, промјена у саставу микрофлора била је још израженија, мања је тежина учесника у експерименту.

Истовремено у истој лабораторијских експеримената су изведене на лабораторијским мишевима који носе мутацију у гену за лептин - "ситост хормонског" протеина који се синтетише у масном ћелијама ткива, и ставља свој допринос формирању ситости. Мишеви који су оштетили обе копије овог гена (ова мутација означава Леп об индекс) једу 70% више од дивље врсте, уз све последичне последице. А садржај фирмицутес у цревима и по пута већа него у хетерозиготних линија, са само једним неисправним алела (об / +), а хомозигот за нормалан ген дивљег типа сојева (+ / +).

Утицај микрофлора на метаболизам његовог "домаћина" истраживача тестираног на другом моделу - гнотобиотски мишеви.

Такве животиње, од тренутка рођења која живе у стерилним коморама и никад се нису срела са неким микробима у својим животима, се често не користе у биомедицинским истраживањима. Апсолутна стерилитет мисхатнике, раббитри а посебно коза амбар - скуп и проблематични, а након састанка са првим микроба или вируса или лошег умре или постане неподесан за даље експерименте. Оно што се догађа у гнотобиотима са имунолошким системом је одвојена прича, а једу три, ау исто време - кожу и кости због недостатка микробиолошке компоненте варења.

После трансплантације микрофлоре од гојазних (об / об) донора, гнобоботски мишеви су били готово 50% т.е. две недеље (за 47%). Они који су "посејани" микрофлора из дивљих (+ / +) донатора са нормалном тежином, опоравили су само 27%.

Резултати даљег истраживања промена у симбиозном мишићном микроорганизму бриљантно потврђују хипотезу да микробиота гојазних особа доприноси дубљу обради хране. Упоређивање узорака ДНК столице код гојазних и нормалних мишева показало је да су мишеви гојазних мишева засићени ензимским геном који омогућавају ефикасније распадање полисахарида. Интензитет гојазних мишева садржи велике количине финалних производа ферментације - једињења сирћетне киселине и маслацке киселине, што указује на дубљу прераду компоненти хране. Калориметријска анализа (од речи "калорија"!) Анализирали смо узорке столице: об / об мишева столица садржала је мање калорија од мишева дивљег типа које нису у потпуности апсорбовале енергију из хране.

Поред важне информације о "клица" компоненту гојазности, аутори су могли да покажу суштинску сличност између микрофлоре гојазних људи и мишева, што отвара нове перспективе у проучавању проблема вишка килограма, а можда - и да реши овај проблем "трансфера" здрава микрофлора или њеног формирања код пацијената, пате од гојазности.

Чињеница да микробиота може контролисати метаболизам домаћина више није у сумњи. Студије Гордоне лабораторијски посвећене проблем прекомерне тежине је могуће да се премости јаз у лечењу болести метаболизма, као што су кахексија, утиче на децу од једне године до четири године у сиромашним тропским земљама - маразмус (до идиотизма та реч има само лингвистички: грчких марасмос. дословно значи пражњење, изумирање) и квасхиоркор (на језику једног од племена Гане квасхиоркор - "red boy"). Појава болести повезаних са недостатком протеина и витамина у прелазу од дојења до одрасле хране. Али болест селективно утиче на децу, чија браћа и сестре нису имали проблема са транзицијом на традиционалну исхрану у региону. Студије су показале да је цревне микрофлоре болесне деце се веома разликује од микрофлоре њихових родитеља, као и микрофлоре здраве браће и сестара. Пре свега истакао скоро потпуно одсуство цревне популације Бацтероидетес и доминације ретких врста из типова протеобактерије и Фусобацтериа. Након болесна деца (пазећи да се не предозирати!) Товних тешко протеина хране, њихов микробиота постаје сличан у нормалу, као што су рођаци, са превласт Бацтероидетес и фирмицутес.

Студије последњих година нису радикално промениле преовлађујуће идеје о цревној микрофлори човека, већ су допринеле и појави концепта који микробиото црева сматра додатним вишецелијским "органом" људског тела. Орган који се састоји од различитих ћелијских линија, способних да комуницирају једни са другима, као и са домаћим организмом. Орган који редистрибуира токове струје, врши важне физиолошке реакције, промене под утицајем околине и саморевише с промјенама изазваним спољашњим условима.

Наставак истраживања "бактеријска тело" може и треба да доведе до разумевања закона њеног функционисања, откривања његових деликатним односима са домаћином и, као последица тога, појаве нових метода у борби против болести код људи циљаним лечењу поремећаја обе метаорганизма компоненти.

Др Валери Пороико
Универзитет у Чикагу, Одсек за општу хирургију
Портал «Етернал Иоутх» ввв.вецхнаиамолодост.ру

Верзија чланка објављена је у "Популар Мецханицс" бр. 4-2008

Специфична идентификација бактерија методом секвенцирања 16С гена рибосомалне РНК, улога и место методе у дијагностици бактеријских инфекција. Завршено: Савелиева. - презентација

Презентација је објављена пре 4 године од стране Лудмила Шумихина

Повезане презентације

Презентација 11. разреда на тему "Специфична идентификација бактерија методом секвенцирања 16С гена рибосомалне РНК, улога и место методе у дијагнози бактеријских инфекција. Завршено: Савелева". Преузмите бесплатно и без регистрације. - Транскрипт:

1 Врста идентификација бактерија секвенцирањем 16С ген рибозомске РНК, улози и мјесту метода у дијагностици бактеријских инфекција испуњено: Савелиева Ксениа испуњени: Савелиева Ксениа, ученик 11 специјализована цласс ученик 11 специјализовани цласс МБОУ Краснообск СОСХ 1 МБОУ Краснообск СОСХ 1 Супервисор: Супервисор : Цанд. Биол. Науки Афониусхкин Василь Николаевич Цанд. Биол. Науки Афониусхкин Василь Николаевич

2 Циљеви: 1. Мастер ДНК електрофорезе на агароза гелу 2. Научити методу за анализу резултата секвенцирања, и врше изградњу нуклеотидних секвенци, генских фрагмената 16 С рибозомална РНК изолата магистрирала рода Бациллус 1. ДНК електрофорезе на агароза гелу 2. Научити поступак за анализу резултата секвенцирање и спроводи изградњу нуклеотидних секвенци, генских фрагмената 16 С рибосомал РНК изолата добијеног генус Бациллус 3. Испитати перспективу дељења технике секвенцирање и биохемију цал идентификација бактерија 3. да проучи изгледе дељења метода за секвенцирање, и биохемијска идентификација бактерија Циљ: Проучавање могућности начину специфичне идентификације бактерија секвенцирањем 16С рибозомске РНК у комбинацији са традиционалним методама идентификације

3 материјали и поступци Чисте културе изолата су постављене на МПА сати и после инкубације бактерија Суспензија је припремљена у фосфат-пуферном соли. Култура грам обојене и микроскопировали. Процијенити након биохемијским својствима: Одлагање цитрат, малонат, глукозу, лактозу, манитол, сахарозу, инозитол, сорбитол, арабиноза, малтоза, фенилаланина, формирање индола, водоник сулфид атсетилметилкарабинола (Реацтион Фогес- Проскауер), присуство бета-галактозидазу, уреазе, аргинин декарбоксилазу и лизин, аргинин хидролазу. Културе су тестирани на каталаза, цитохром оксидазе активност, формирања нитрита, пигмента синтеза, отпорност на антибиотике, а студирао културу и морфолошких својства. Бета-галактозидаза и тритофандезаминазнуиу глиукоронидазнуиу активност је тестирана на средњем Уриселект 4 (БиоРад) ДНК је изолована фенолхлороформенним приказу одређена на основу редоследу 16С рибосомал гена РНК интерференције фрагмент интергенски дистанцер рибозомске РНК и 16-23С плуралности биохемијских, културне и морфолошке карактеристике.

4 Културна својства: гајене културе нису расле на окружењу Ендо; нису односе на ентеробактерије, гајених на месо Пептон агар под аеробним условима на 37 ° Ц бојење својства: култура узгаја прегледао микроскопски и Грам-бојење који дозвољава да утврди да добијена култура су споре Ги + штапићи Цхарацтеристицс Цултурес

5 Шема истраге: ДНК је узгајана из одраслих култура и ПЦР је примењен са универзалним прајмерима, због чега смо појачали фрагмент 16С гена рибосомалне РНК

6 раствором прајмером распоређених у 4 епрувете, од којих је сваки четири деоксинуклеотидне дАТП, дЦТП, дТТП (оне радиоктивним изотопа обележеним) и један од четири 2; 3- дидеокинуцлеотидес (ддАТР, ддТТР, ддГТП дд МФР) дидеоксинуклеотида Ова апликација се у свим позицијама растуће ланцима мешавине, а након приступања раст ланца се одмах зауставља. Као резултат тога, у свакој од четири цеви уз учешће ДНК полимеразе генерише јединствени сет олигнуклеотидов различитим дужинама обухватају праимеровуиу секвенцу. Надаље, цеви су додати у формалид дивергенције ланаца и електрофорези на гелу полиакрилне цхетерих нумера. Проведите ауторадиографију, што га чини могуће "процитао" секвенцирање секвенцу нуклеинске сегмента ДНК. У биохемије и молекулске биологије електрофорезом се користи за раздвајање макромолекуларних протеине и нуклеинске киселине (и њихове фрагменте). Постоји много варијанти ове методе. Овај метод налази широку примену за одвајање смеша биомолекула исувише фракција или појединачних супстанци и користи се у биохемије, молекуларне биологије, клиничка дијагностика, Популатион биологи (за изучавање генетичке варијација) и др.белковнуклеинових киселине електрофореза тхис електрокинетички феномен истискивање дисперзне фазе (колоидна или протеина раствор) у облику течног или гасовитог медијума деловањем екстерног елецтриц полиа.електрокинетицхеское иавлениеелектрицхеского полиаЕлектрофорез Шема студије: ПЦР продукти су раздвојени електрофорезом на агароза гелу. Сангерова метода

7 Резултати сопственог истраживања Фиг.1 Резултати капиларне електрофорезе фрагмента 16 С гена рибосомалне РНК

8 Фиг. 2 филогенетско стабло изграђено на основу резултата поравнања фрагмента 16С гена рибосомалне РНК

9 Резултати сопственог истраживања Фиг. 3 Резултати поређења нуклеотидних секвенци

10 Резултати биохемијским студијама култура коришћењем тест ПБДЕ Биохемијски својства соја Б.лицхениформис: негативан коришћења цитрат, малонат негативан, натријум цитрат + глукоза негативан негативан лизин, аргинин негативан, негативан орнитин, фенилаланин негативан, индол негативан, уреазу позитивно атсетилметилкарабинол негативно сулфид негативан, поситиве, глукоза, б-галактозидазе позитивни, негативни лактозу, манитол позитивно, позитивно сахарозу, инозитол позитивно о, сорбитол је позитиван, малтоза је позитивна

11 Закључак врста Идентификација микроорганизама на основу секвенцирање може бити "златни стандард" за лабораторијску дијагностику, али тачност метода је ограничена поузданост и потпуност бази података Гене Банк и стога захтева употребу додатних потврдни тестова.

Анализа 16с РНК

Биотехнологија, 2005, №6, од 3-11

Поступак за идентификовање микроорганизме, на основу анализе рестрицтион фрагмент ленгтх полиморфизама (РФЛП), ПЦР производ гена РНА 16С дужине 1500 нуклеотида. 6 матцхед сет ендонуклеаза рестрикције (Ссе9И, Тру9И, БсуРИ, МспИ, БстМБИ и РсаИ), користећи РФЛП омогућава идентификацију широког спектра микроорганизама.
Из изолата из природних морских вода изоловани су четири изолата термолабилне алкалне фосфатазе. РФЛП анализа спроведена за ових сојева у поређењу са резултатима добијеним израчунатих за 16С РНК гена различитих микроорганизама, открила је да су идентификовани произвођачи припадају роду Алтеромонас.

Заједно са традиционалним методама идентификације микроорганизама помоћу културних и морфолошке карактеристике, као хемијске и биохемијске реакције [1], у последње време све више и више користи метода за одређивање микроорганизама се заснивају на поређењу нуклеотидних секвенци гена различитих микроорганизама [2-4] и dužina polimorfizam анализа ДНК рестрикционих фрагмената добијених појачавање специфичних бактеријских гена [5,6]. Већина су погодни за утврђивање гена који кодирају 16С и 23С рибозомске РНК јер су присутни у свим бактеријским ћелијама су род-специфичне и за већину микроорганизама [7-9]. Користи за идентификацију ДНК фрагмент који садржи оба гена 16С и 23С РНК и одстојник налази између њих и више варијабилна, омогућава да направе разлику између блиско сродних врста и подврста микроорганизама [10].

У раду су приказани резултати РФЛП анализом ПЦР производа 1500 нуклеотида у дужину за различите микроорганизме и показала да коришћење ограничења ендонуклеаза 6 Ссе9И, Тру9И, БсуРИ, МспИ, БстМБИ РсаИ и који поуздано идентификује већину микроорганизама. Папир идентификовао 4 нев продуцент тхермолабиле алкалне фосфатазе и предложене методе, компаративну анализу РФЛП за идентификацију ових микроорганизама. На основу поређења закључује да резултати произвођачи припадају роду Алтеромонас.

ЕКСПЕРИМЕНТАЛНИ УСЛОВИ

Да се ​​детектује производња тхермолабиле алкална фосфатаза 50 л морске воде је тритурисан у нутриената агар површини и анализирани као што је описано у [11]. Производња биомасе микроорганизама вршена је узгајањем произвођача на 20 ° Ц у брозу која садржи 1% триптона (АГС ГмбХ, Немачка), 0,5% квасног екстракта (исте фирме) и морске соли (НаЦл-27,5, МгЦл2 - 5, МгСО4 - 2, ЦаЦл2 - 0.5, КЦл - 1, ФеСО4 - 0.001 г / л [12]), пХ 7.2 - 7.7. Семена бујица је дистрибуирана у 200 мл до 700 мл волуметријске буради и потресена на 150 обртаја у минути током 16 сати.

Изолација хромозомске ДНК изведена је методом [13].

Амплификација 16С гена рибосомалне РНК изведена је полимеразном ланчаном реакцијом како је описано у [14].

Реакциона рестрикција амплификоване ДНК изведена је током 4 сата на 37 ° Ц у 20 μл реакционе смеше која садржи 2ек. чинити. Ограничење Ссе9И, Тру9И, БсуРИ, МспИ, БстМБИ или РсаИ НПО "СибЕнзиме", у погодном пуферу. Реакција је заустављена додавањем 5 ул сталног раствора који садржи 0.1 М ЕДТА, 0,05% бромфенол плаве и 40% сахарозе.

Електрофоретско раздвајање рестрикционих производа амплификоване ДНК је изведена на 2% агароза (Сигма) у Трис-ацетат пуферу са етидијум бромид (0,5 мг / Л) на 120 В 4 сата.

Маркери ДНА молекулске тежине (100бп +1,5 Кб ДНК маркери, НВО "СибЕнзим") коришћени су за одређивање дужине фрагмената ДНК. Дужина добијеног ограничења одређена је помоћу рачунарског програма Гел Про Анализер, верзија 4.0.00.001. Проценат идентитета дужине фрагмента израчунава се за сваки пар микроорганизама упоређивањем обрасца ограничења посебно за сваки рестрикцијски ензим. Када се упореде дужине ограничења, процењени ДНК фрагменти идентични по дужини су различити за не више од 5%.

Да би се упоредили експериментални подаци са објављеним секвенцама гена 16С РНК, коришћена је генетичка база секвенцираних секвенци.

РЕЗУЛТАТИ И ДИСКУСИЈА

Четири изолати из соја природни произвођача тхермолабиле фосфатазе су изоловани контакт морску, назначено као 20, 27, 48 и соја карактеришу претходно [11] коришћењем конвенционалних техника као што је Алтеромонас Ундина. За идентификацију сојеви изведене из биомасе микроорганизама гајених у течној хранљивој подлози са обогаћеним са морском сољу била изолована хромозомске ДНК.
Надаље, хромозомска ДНК је коришћена у полимеразној ланчани реакцији за амплификацију 16С гена рибосомалне РНК. Производ амплификације је независно третиран са 6 различитих ограничења ендонуклеазе. Све смо користили тетрануцлеотиде ограничење ендонуклеазну место препознавања, који омогућава добијање од 3 до 8 ДНК фрагмената проистичу из цепањем амплификације производа, који има дужину око 1500 бп. Рестрикционим ензимима и половне Ссе9И Тру9И су респективно ААТТ места препознавања и ТТАА док БсуРИ и МспИ ограничење ензима сечених места ГГЦЦ и Ццгг. Локације за препознавање ензима рестрикције БстМБИ и РсаИ, односно ГАТЦ и ГТАЦ, садрже у свом саставу сва четири нуклеотида. Овакав избор рестонзивних ендонуклеаза, по нашем мишљењу, треба да обезбеди универзалност у идентификацији микроорганизама који имају и богате АТ и ГЦ богате геноме. У квантитативном смислу, употреба само шест различитих ограничења верујемо оптимално решење, пошто употреба ограничења ендонуклеаза 1 или 3, као што је предложено у неколико студија [10,15] не може да открије полиморфизам за идентификацију блиско повезаних организама или, алтернативно, да доведе до сувише велике разлике ИЗ за једну или више случајних мутација. Међутим, употреба 10 различитих рестрикционих ендонуклеаза не изазива додатна детекција дужина полиморфизам ДНК рестрикционих фрагмената јасно редундант [9].
Слика 1 приказује симулирано применом ограничење рачунарског слике генов16С РНК смо предложили скуп шест рестрикционим ензимима (Ссе9И, Тру9И, БсуРИ, МспИ, БстМБИ и РсаИ). Гени 16С РНК узимани су у генетској банци секвенцираних секвенци. Избор микроорганизама био је сасвим случајан. Све бактерије припадају различитим родовима и представљају грам-негативне и грам-позитивне микроорганизме. Може се видети да за све микроорганизме постоји јединствени образац скупа рестрикцијских ензима. Број фрагмента ДНК креће се од 23 до 30 (дужина фрагмената мања од 100 парова нуклеотида се не узима у обзир). Резултати обрачуна процента идентитета дужине ДНК фрагмената (рестриктивни фрагмент сматрају идентичним дужине разликују за не више од 5%) за различите парове микроорганизама приказаних у Табели 1. Ова табела показује само део могућих парова микроорганизама приказаних на слици. 1. Међутим, резултати поређења се приказани довољно препознатљив и оставити да видимо да је проценат идентитет дужине ДНК фрагмената обично идео од 12-28% за чланове различитих родова микроорганизама. Стога, ови подаци показују да ограничење образац гена 16С РНК предложио контакт скуп рестрикционих ензима може послужити као основа за идентификацију генерички додатну опрему Станице бактеријске ћелије.

Сл. 1. Теоретски израчуната образац електрофоретског раздвајања 16С РНК амплификацију гена производе након третмана са рестрикционим ензимима Ссе9И (1), Тру9И (2), БсуРИ (3), МспИ (4), БстМБИ (5) и РсаИ (6). Траке М - маркер молекулске тежине

Вредност 16С РНК у таксономији. Молекуларна хибридизација 16С РНК.

Молекуларна хибридизација 16С рРНК. Прокариотски рибозом састоји се од 3 подјединице, велике (23С), (5С) и (16С). Гене 16С рРНА има следећа својства, важна у филогенији:

1. РНА Рибосоми су универзални за различите врсте, као што су сами рибосоми. 2. Молекула 16С рРНА је конзервативна и најмање подложна променама у току биолошке еволуције. Стопа промене 16С рРНА гена у различитим симбиотским бактеријама била је 2-4% нуклеотидних супституција у року од 60 дана.3. Гене 16С рРНА има и ултраконсервативне и варијабилне домене (домене), што омогућава оцену далеких и блиско повезаних односа.4. Поред тога Штавише, утврђено је да рРНА цистрони нису укључени у процесе генетског трансфера међу врстама.5. Величина ген (у прокариотима је око 1550-1640 бп дуг) оптималан је са становишта смањења статистичких грешака. Пун поступак се може одредити у једном секвенционирању методом Сангер-а.Поређење нуклеотидних каталога. Метода је коришћена почетком 80-их и имала је велики историјски значај у систематизацији бактерија. У овом случају, молекул РНК (16С рРНА) је третиран са рибонуклеазама Т, који раствара молекул над остацима гванина. Величина добијених фрагмената није била већа од 20 нуклеотида. Добијени олигонуклеотиди су одвојени помоћу 2-мерне електрофорезе, секвенционисани и састављени су у каталогу који специфично карактерише молекул рРНК. Приликом упоређивања каталога узети су у обзир фрагменти од најмање 6 нуклеотида. Примјеном коефицијената сличности између каталога, прво је изграђено опће филогенетско стабло за прокариоте. Рибопринтинг. Метода се заснива на рестрикционој анализи рРНК гена. Да бисте то урадили, изолујте укупну ДНК из ћелије. Требати два прајмера хомологна високо конзервиран бочних региона 16С рРНК (Смалл подјединица - сс рДНА) ген, а ПЦР је извршена. Фракције се третирају са неколико рестрикцијских ендонуклеаза, а производи за ограничавање за сваку од ендонуклеаза се одвајају у агарозном гелу заједно са профилом величине ДНК. Полиморфизам дужине фрагмената произлази из чињенице да неки од рестрикцијских мјеста спадају у конзервативне домене гена, а неке - у варијабилне домене. У исто време, неки фрагменти ће бити уобичајени за све врсте у узорку. Према броју обичних и различитих фрагмената, могуће је израчунати генетичку дистанцу између врста. Употреба 12 рестрикцијских ензима са места препознавања 4 дуга нуклеотида омогућава анализирање 10-15% дужина 16С рРНК гена без прибегавања секвенционирању.

Драги микроб

Валери Пороико,
Докторат, Универзитет Чикаго, Одсек за општу хирургију
Популар Мецханицс ​​№4, 2008

Пре само сто година, микробе које живе у људском цреву биле су фреелоадерс и штеточине. Последњих година, људски микробиотик назван је нека врста органа нашег тела, неопходног за нормалан живот тела.

Пошто је време Пастеур познато да гастроинтестиналном тракту човека - то је у суштини тип биореактор ток у коме мноштво микроорганизама настањују. Став научника према цревној микрофлори током овог времена радикално се променио. Пре сто година, велики Иља Мечникова, оснивач модерне теорије имунитета, за стварање од којих је добио Нобелову награду (за две особе са својим неумољиве противник, не мање од великог Пол Ерлих), чак предложио уклањање дебелог црева као начин за продужење живота. И оне којима је ова мера је изгледало сувише радикалан, препоручује се да пије пуно јогурта да раселе штетна, по његовом мишљењу, микроби благотворно лактобацила. За пола века курс се променио за 180 степени. Испоставило се да су нормалне цревне микрофлоре, као и коже и слузокоже за обављање многе корисне функције - на пример, потискују виталне функције тела су стално нападају патогене. И у последњих неколико година, највише смело од микробиолога су отишли ​​даље изјавом лица и његове симбиотичку микроба један суперорганисм.

Развој техника молекуларне биологије донела је научницима нови ниво разумевања процеса симбиозе човјека и његове микрофлоре, што је изгледало добро проучити, и на даљу истрагу да није очекивао било изненађења. Стопа брз раст и пад трошкова метода ДНК секвенцирања (утврђивање његовог нуклеотидне секвенце) и паралелни повећање моћи персоналних рачунара и развој Интернета омогућила је анализу информација о великих региона генома. Након хромозому стотина појединачних бактерије врсте транскрибовани у новом генетику микроорганизама приступ - популатион: анализа гена једном све бактерије настањују одређену станиште. Наравно, становништво "људског биореактора" испоставило се као једно од најважнијих за проучавање микробних популација.

Први посао који је потпуно нов начин гледања на цревне мицробиота, објављен је 1999. године од стране групе научника из Националног института за агрономских истраживања (Француска) и Универзитета у Редингу (УК). Аутори су одлучили да користе метод секвенцирања 16С РНК гена за проучавање популације микробних цревних ћелија (погледајте бочну траку).

16С ПХК - идентификација бактерија

Прва фаза одређивања микроорганизама је њихова култивација на хранљивим медијима. Али неки микроби не желе да расту на било ком медијима

Модерне технике
Студи претходно неприступачним нон-цултурабле бактерије и почињу да уведе ред у потпуно конфузне таксономију већ познате прокариотским постало могуће развојем биоинформатици и појаве модерних техника молекуларне биологије - ПЦР дозвољава једном ДНК регион да прима милијарде реплике, клонирање изабрани ген у бактеријских плазмида и секвенцирање секвенце методологије нуклеотиди добијени у довољној количини за анализу. Идеалан маркер за идентификацију микроорганизама показали геном који кодира 16С рибосомал РНК (сваки од два рибосома субјединице - радионице синтезу ћелијског протеина - садржи преплитања ланаца протеинских молекула и рибонуклеинских киселина).

Савршен маркер
Овај ген је у геному свих познатих бактерија и арцхаеа, али нема у еукариота и вируса, а ако нађе карактеристичан низ нуклеотида - да ли сте сигурни да се баве гена Прокариотес. Овај ген има и конзервисани региони су исти у свим прокариотима и врста специфичне. Конзервативне парцеле су за прву фазу полимераза ланчаном реакцијом - додавање циљне ДНК до прајмера (семена ДНК делови којима проучавао нуклеотида ланца треба да уђе да бисте започели анализирање остатак секвенце) и са специфичним врстама - за идентификацију врста. Степен сличности локалитета специфичних за врсту одражава еволутивни однос различитих врста. За клонирање и накнадну анализу може се користити само рибосомална РНА, која у било којој ћелији је присутна у већој количини од одговарајућег гена. Нуклеотидне секвенце 16С РНК свих познатих бактерија и археа су генерално доступне. Идентификоване секвенце се упоређују са онима пронађеним у базама података и идентификују врсту бактерије или изјављују да она припада некултурираној врсти.

Нова систематика
Недавно, постоји интензивна преглед старог, фенотипска класификација бактерија на основу лоше формализовани критеријума - од појаве колонија на преференције хране и способност да се фарба различите боје. Нова систематизација се заснива на молекуларним критеријумима (16С РНА) и само делимично понавља фенотип.

Шта имамо унутра

Секвенце кодирање 16С РНК полимераза ланчаном реакцијом (ПЦР) је повучен директно из "окружења" - 125 мг хуманог, извини, столица је убачен у Е. цоли плазмида (не због тога интестинални, и зато Есцхерицхиа цоли - једна од омиљених радника молекуларних биолога) и поново изолована из културе помножених бактерија. Тако је створена библиотека са 16С РНК геном за све микроорганизме у узорку. Након тога, 284 клона су насумично изабране и секвенциране. Испоставило се да су само 24% резултујуће 16С РНК секвенце припадале раније познатим микроорганизмима. Три четвртине микрофлоре се налази у цревима сваког људског бића, више од стотину година избегавао пажњу истраживача, наоружани са методама класичне микробиологије! Научници једноставно нису могли наћи услове за култивисање ових бактерије, пошто највише ћудљив становници црева одбио да порасте на традиционалним микробиолошким срединама.

До сада, користећи молекуларне методе, утврђено је да је 10 од 70 великих бактеријских таксона присутно у микробиоти одраслих. Око 90% наших микроба припада типу фирмицутес (ово укључује, на пример, познати лактобацила - главни "кривци" соуринг млеко) и Бацтероидетес - обавезати анаероба (организми који могу да живе само у одсуству кисеоника), који се често користе као показатељ загађења природна канализација. Преосталих 10% становништва подељена између таксона протеобактерије (што укључује, између осталог, Е. цоли), Ацтинобацтериа (из једне од врста актиномицета антибиотика стрептомицина је изолован), Фусобацтериа (нормалне становници усне дупље и често изазивају пародонтопатија), Верруцомицробиа (недавно у геотермални извор је открио облик микроба који се хране на метан, који обилују у цревима због других микроорганизама), Цианобацтериа (они су и даље често називају старом - "плаво-зелене алге»), спирохете (на срећу НД, не бледи), Синергистес и ВадинБЕ97 (каква животиња, питајте креатори новог таксономији прокариота).

Микробиолошки у нама је више од људског

За ту сврху, највише аутоматизована, компјутеризовани и високих перформанси ДНК секвенцирање технологија, дајући прилику да анализирају кратку нуклеотидну секвенцу, саставите загонетку неколико преклапања "слова" на крајевима ових локација више пута да поновите ову процедуру за сваки комад генома и да добију транскрипте појединачних гена и хромозома са убрзати до 14 милиона нуклеотида на сат - реда магнитуде брже него што је то учињено пре само неколико година. Стога, утврђено је да је интестинална микробиота има око 100 трилиона бактеријских ћелија - око десет пута више од укупног броја хуманих ћелија у организму.

Скуп гена који чине бактеријски метагеном је око сто пута већи од скупа гена људског тела. Ако говоримо о запремини биокемијских реакција које се јављају унутар микробиолошке популације, то поновљено више пута превазилази волумен биокемијских реакција у људском телу.

Бактеријски "Реацтор" спроводи у домаћину метаболички ланцем да то није у стању да се подрже - на пример, синтеза витамина и њихови прекурсори, разградња неких токсина, разлагање целулозе према сварљивих полисахарида (у преживара), итд...

Од детињства до старости

Упркос чињеници да је састав врста честих микроорганизама прилично монотоничан, квантитативни однос представника одређених систематских група у микробиоти различитих људи може значајно да варира. Али шта је то нормална цревна микрофлора и какви су начини његовог формирања?

На ово питање је одговорено 2007. године у раду групе америчких биолога под водством Патрика Брауна са Универзитета Станфорд. Они су пратили формирање микробиоте код 14 новорођенчади током прве године живота. Аутори су успели да успоставе неколико извора колонизације гастроинтестиналног тракта. Микробиота беба је била слична микрофлору мајке: вагинални, фекални или микрофлора узорака мајчине масти. У зависности од извора колонизације, у микрофлору црева дојенчади током прве године живота, преовладавају различите врсте. Ове разлике су остале значајне током читавог периода истраживања, али у доби од једне године постале су очигледне особине формирања одрасле микробиоте. Занимљиви подаци су добијени коришћењем пара близанаца. Њихова микрофлора је практично идентична у саставу и на исти начин варира. Овај налаз открио је огромну улогу људске компоненте пар "микробиота-домаћина" у формирању популације цревних микрофлора. За чистоту експеримента, наравно, треба имати одвојене бебе још у болници (Узгред, дивна прича за индијски филм! Много година касније, близанци упознају једни друге на анализу микрофлоре.). Али друге студије подаци су потврдили претпоставку да је појединац, укључујући наследне, карактеристике људских биохемија имају велики утицај на састава мицробиота.

Танак и дебео

Студије спроведене у лабораторији Јеффреи Гордон (Сцхоол оф Медицине на Универзитету Вашингтон, Ст. Лоуис, МО), ће повезати разноликост бактерија гастроинтестиналног тракта са дијетом и карактеристика индивидуалног метаболизма. Експериментални резултати су објављени у издању часописа децембра Природа за 2006. годину. Годишњи експеримент је предложио успостављање корелације између вишка телесне масе и састава микробне популације његове цревине. Десетине младих који су пристали да ставе своје стомаче на олтар науке подељени су у две групе. Једно село на дијети са мастима, друго - са садржајем угљених хидрата. Сви волонтери су изгубили тежину, а истовремено су променили однос две главне групе микробних цревних ћелија: број ћелија Фирмицутес-а се смањио, а број Бацтероидетес-а, напротив, повећао се. На исхрану са ниским садржајем масти, ова промјена је постала примјетна касније - након што су пацијенти изгубили 6% тежине, а на исхрану са ниским садржајем карабина - након губитка првих килограма (2% почетне телесне тежине). У исто време, промјена у саставу микрофлора била је још израженија, мања је тежина учесника у експерименту.

Борба против гојазности

Резултати даљег проучавања од научника променити миша симбиотички микроорганизама (види. Оквир "тестиран на мишевима") брилијантно потврдили хипотезу да микробиота гојазних појединаца побољшава дубоку обраду хране. Упоређивање узорака ДНК столице код гојазних и нормалних мишева показало је да су мишеви гојазних мишева засићени ензимским геном који омогућавају ефикасније распадање полисахарида. Интестине гојазних мишева садржао велики број крајњих ферментираних производа - једињења сирћетне и бутерне киселине, што указује детаљнији компоненти прехрамбена. (! Од речи "калорија") калориметар анализе узорака потврдила да је мишје: Катедра ОБ / ОБ-мишеви садрже мање калорија него код дивљих типова мишева који нису потпуно савладали енергију из хране.

Поред важне информације о "клица" компоненту гојазности аутора успели да покажу суштинску сличност између микрофлоре гојазних људи и мишева, што отвара нове перспективе у проучавању проблема вишка килограма, а можда реши овај проблем "трансфера" здрава микрофлора или њеног формирања код пацијената пате од гојазности.

Тестиран на мишевима

И са исцрпљењем

Чињеница да микробиота може контролисати метаболизам домаћина више није у сумњи. Истраживање Гордонове лабораторије, посвећено проблему прекомерне тежине, омогућило је пребацивање моста на лечење метаболичких болести. Међу њима су такви уобичајени типови трошења, који утичу на децу од једне до четири године у сиромашним земљама са тропском климом, као што је марасмус (у Марасмусу ова реч има само језичку релацију: грчки. марасмоз буквално значи исцрпљеност, изумирање) и квасхиоркор (на језику једног од племена Гане квасхиоркор - "црвени дечак"). Појава болести повезаних са недостатком протеина и витамина у прелазу од дојења до одрасле хране. Али болест селективно утиче на децу чији су браћа и сестре нису искусили никакве проблеме са преласком на традиционални начин исхране овог региона. Студије су показале да је цревне микрофлоре болесне деце се веома разликује од микрофлоре њихових родитеља, као и микрофлоре здраве браће и сестара. Пре свега истакао скоро потпуно одсуство цревне популације Бацтероидетес и доминације ретких врста из типова протеобактерије и Фусобацтериа. Након болесна деца (пазећи да се не предозирати!) Товних тешко протеина хране, њихов микробиота постаје сличан у нормалу, као што су рођаци, са превласт Бацтероидетес и фирмицутес.

Недавне студије не само радикално променила владајућим појмове људских цревне микрофлоре, али и допринели настанку концепта, који сматра цревни Мицробиота као додатни више ћелијском "тела" човека. Орган који се састоји од различитих ћелијских линија, способних да комуницирају једни са другима, као и са домаћим организмом. Орган који редистрибуира токове струје, врши важне физиолошке реакције, промене под утицајем околине и саморевише с промјенама изазваним спољашњим условима. Наставак истраживања "бактеријска тело" може и треба да доведе до разумевања закона њеног функционисања, откривања његових деликатним односима са домаћином и, као последица тога, појаве нових метода у борби против болести код људи циљаним третман дисфункција две компоненте метаорганизма.

Анализа 16с РНК

Рибосомалне рибонуклеинске киселине (рРНА) - неколико РНК молекула који чине основу рибосома. Главна функција рРНК је имплементација процеса превођења - читање информација из мРНК помоћу прилагођавања молекула тРНК и катализе формирања пептидних веза између везаних аминокиселина тРНК.

Садржај

Рибосомске подделнице и номенклатура рРНК

На електронско-микроскопским сликама интактних рибозома примећује се да се састоје од две под-честице различитих величина.

Однос масе подјединица је

2: 1; масс, заузврат, изражено у константама измереним непосредно таложење (рјешавање стопу сведберг јединицама, и) ултратсентрифуговании, па се овај параметар је основа за номенклатуре рРНК и рибозома и рибозомску субјединица: тип ознаке полован

На пример, рибосомална прокариотска РНК са коефицијентом седиментације од 16 Сведбергових јединица означава се као 16С рРНА.

Пошто коефицијенти седиментације не зависе само од молекулске тежине, већ и од облика честица, коефицијенти седиментације за дисоцијацију нису адитивни: на пример, бактеријски рибосоми са молекулском масом

3 * 10 6 Далтон има коефицијент седиментације од 70С, означен као 70С и дисосотира у подјединице од 50С и 30С:

Рибосомни подјелици садрже један рРНА молекул велике дужине, чија је маса

1/2 - 2/3 масе рибосомног субпартика, тако, у случају бактеријских рибосома 70С, субпартик 50С садржи 23С рРНК (дужина

3000 нуклеотида) и 30С субпартицле садржи 16С рРНК (дужина

1500 нуклеотида); ларге рибосомал субјединице изузев "лонг" рРНК садржи један или два "кратку" рРНК (5С рРНК бактерија 50. рибосома подјединице или 5С и 5.8С рРНА болсхии еукариотским рибосома подјединица).

Синтеза

Рибосомална РНА представља велики проценат (до 80%) укупне ћелијске РНК, таква количина рРНК захтева интензивну транскрипцију својих кодних гена. Овај интензитет обезбеђује велики број примерака рРНА кодираних гена: код еукариота постоји неколико стотина (

200 квасца) до десетина хиљада (за различите линије памука пријавили су 50 - 120 хиљада примерака) гена организованих у низовима тандем понављања.

Код људи, гени који кодирају рРНК такође су организовани у групе тандемских понављања лоцираних у централним регионима кратких кракова 13, 14, 15, 21 и 22 хромозома.

Они се синтетишу помоћу РНК полимеразе И као дугог молекула пре-рибозомске РНК, која се пресече у појединачне РНК које чине основу рибосома. У бактеријама и археји, почетни транскрипт обично укључује 16С, 23С и 5С рРНА, између чега се пре-рРНА секвенце уклањају током обраде. Обично се један или више тРНК гена налазе између 16С и 23С рРНА гена; Тако, у Е. цоли иницијални транскрипт такве групе гена има следећи низ:

(16С рРНА) - (1-2 тРНА) - (23С рРНА) - (5С рРНА) - (0-2 тРНА)

Овакав транскрипт се дели на фрагменте пре-рРНА и тРНК од стране рибонуклеазе ИИИ.

У еукариотима 18С, 5,8С и 25/28 рРНК су ко-транскрибовани са РНК полимеразом И, док је 5С рРНА ген транскрибиран РНК полимеразом ИИИ.

Код еукариота, гени концентрација спаце енцодинг рРНК, обично јасно видљива у ћелијском једру, услед акумулације од око субјединице рибозома, који су селф-ассембли одвија одмах. Ови гроздови добро обојених цитолошких боја и су познати као нуклеолуса. Сходно томе, присуство нуцлеоли није специфична за све фазе ћелијског циклуса: подела једног нуклеуса ћелија код Пропхасе одваја јер рРНК синтеза и поново суспендован крајем телофаза формира приликом наставка синтезу рРНК.

Упоредна анализа про- и еукариотске рРНК

Рибосомал РНК (ас рибозома) прокариоти и еукариота разликују међусобно, мада показују значајне сличности секвенце секције. Прокариотски 70С рибозом обухвата велики 50С подјединицу (изграђену на бази два молекула рРНК - 5С и 23С) и 30С малу подјединицу (изграђени на основу 16С рРНК). 80С еукариотична рибозом састоји од великог 60С подјединицу (конструисали на основу три молекула рРНК - 5С, 5,8С и 28с) и 40С малу подјединицу (конструисали на основу 18С рРНК).

Употреба информација о секвенци

Информације о рРНК одређеног организма се користе у медицини и еволуционој биологији.

  • Ген рРНК је један од најконзервативнијих (најмање варијабилних) гена. Због тога се систематска позиција организма и време раздвајања са сродним врстама могу одредити на основу анализе сличности и разлика у рРНК секвенцама.
  • рРНК је мета великог броја антибиотика, од којих су неки користе у клиничкој пракси, како за инхибирање раста бактерија (антибиотика, везивања прокариотском рибозома) и за лечење хуманих болести (антибиотици везују за еукариотске рибосому). У прву групу спадају хлорамфеникол, еритромицин, казугамиеин, микрококксин, спектиномицина, стрептомицин, тиострептон. Другом хигромицину Б, паромомицин.

Повезани Чланци Хепатитис